molekularna destilacija (kratkopotna destilacija), postopek destilacije kemične snovi v visokem vakuumu. Naprava za molekularno destilacijo je izdelana tako, da opravi para izparevajoče tekočine čim krajšo pot do ponovnega utekočinjenja oz. kondenzacije. Pri molekularni destilaciji je temperatura izparevanja nižja za pribl. 200 °C, zato lahko brez toplotnih obremenitev ločujejo zmesi, ki so občutljive za višje temperature.