sekvenčna analiza, določitev zaporedja sestavin v bioloških makromolekulah (nukleinske kisline, beljakovine). Metoda temelji na encimski razcepitvi makromolekulske verige na manjše, razl. dolge odseke, in njihovi ločitvi glede na velikost s fizikalnimi metodami ter analizi sestave odsekov. Pri določitvi genetskih prstnih odtisov uporabljajo za cepitev molekule restrikcijske encime, pri analizi RNK ribonukleaze, pri analizi beljakovin pa peptidaze (npr. pepsin, tripsin). Na podlagi zgradbe makromolekul tudi sklepajo, kakšna je vloga molekule.