endosimbiontska hipoteza [grško], domneva, da so se določeni celični organeli (mitohondriji, kloroplasti) razvili iz sprva samostojno živečih organizmov, ki so se postopoma vključili v celice (endosimbionti). Domnevajo, da so se mitohondriji razvili iz organizmov, podobnih bakterijam, kloroplasti pa iz prednikov modrozelenih alg.